Τον Νοέμβριο του 2019 ο πρωθυπουργός την όρισε ως Εθνική Συντονίστρια για τα ασυνόδευτα προσφυγόπουλα ενώ δύο χρόνια αργότερα ανέλαβε τη θέση της γενικής γραμματέως Δημόσιας Υγείας.
Η Ειδική Γραμματέας για την Προστασία των Ασυνόδευτων Ανηλίκων, Ειρήνη Αγαπηδάκη, καταθέτει σήμερα το μεσημέρι μηνυτήρια αναφορά στον Εισαγγελέα του Αρείου Πάγου